国税庁提出用を選択して出力すると、条件に合致する対象者のみのデータを出力し、

市区町村・国税庁双方提出用を選択すると、全員のデータが出力されます。
※但し、国税に全員分のデータを提出しても問題ありません。

　（国税庁にて条件に合致するデータのみ取り扱います）