年末調整の処理設定で給与年調を選択して登録しようとすると、「処理区分が変更されました。<br /> 
以下の計算結果は削除されます」という警告メッセージが表示されました。これは「OK」をクリックすればよろしいでしょうか?
[年末調整処理設定]画面の[処理区分]を変更した場合、単独年調・再年調の計算結果が削除されるため、注意喚起としてメッセージが表示されます。
単独年調・再年調を実行された時点での源泉徴収票の内容を残すために、
[処理区分]を変更する前に[源泉徴収履歴作成]を実行し、当時の源泉徴収票の情報の保存をお願い致します。
単独年調・再年調を実行した際のデータは削除されますが、
[源泉徴収履歴作成]を実行することで当時の源泉徴収票を残すことができますので問題ありません。
注意点として、「給与年調」で年末調整をされた後に[源泉徴収履歴作成]を実行頂く必要がありますが、
その際には、計算結果を上書きしたくない方は[源泉徴収履歴作成]の対象者に含めないようにしてから更新をお願い致します。
上記の処理が終わりましたら、「OK」をクリックし、再度給与計算を実行してください。